Filtrační materiály, které se v současné době používají při zpracování biofiltrovaných lůžek / bazénů, jsou obou kategorií anorganických a organických filtrů. Neorganické filtry jsou převážně naplněny plynovým betonem, pórovými ceramickými zrny, látkovými částicemi nebo minerálními odpady, organickými filtry jsou kůra, dřevěné kousky, kořeny rostlin, větve, pily, rašelina atd. a jejich směsi. Vzhledem k tomu, že organické filtry jsou levné a snadno dostupné, získají širokou škálu aplikací. V rozvinutých zemích, kůra jako biologický filtr v procesu zpracování výfukových plynů byl široce používán, Čína v chemickém průmyslu, farmaceutickém průmyslu, galvanizace, stříkání barvy, tisku a dalších průmyslových odvětví pro čištění škodlivých znečišťujících plynů a čištění odpadních vod, kompostovací továrny, skládky na odpady a další.